天文台首先在七月十七日晚上10時15分發出一號戒備信號,至七月十八日下午2時15分改發三號強風信號,當時莫拉菲已移至香港東南偏東300公里左右,中心風力達每小時130公里。隨著莫拉菲的外圍雨帶逼近,香港各區於下午時份的天色變得昏暗,開始出現零散驟雨,狂風亦伴著驟雨而來,偏北風開始加強。莫拉菲受北面副高帶來的偏東氣流引導,穩定向西移逼近香港。約在當日下午四時,莫拉菲的首條較強螺旋雨帶自東向西橫掃香港,各區陸續出現狂風驟雨,風力繼續加強,並逐漸轉吹西北風。
天文台在晚上9時半宣佈11時半或以前改發八號信號。直到晚上11時半,莫拉菲移至香港以東100公里左右,天文台發出八號西北烈風或暴風訊號。
到了七月十九日凌晨一時多,莫拉菲移至天文台東北偏東70公里,天文台發出九號烈風或暴風增強訊號。在凌晨時份期間,普遍地區吹偏西烈風,離岸及高地間中吹暴風,大老山、塔門、大美篤、大帽山、橫瀾島、流浮山及昂坪先後錄得颶風程度的陣風,其中大帽山在九號信號發出後一分鐘錄得每小時155公里的陣風,另外打鼓嶺最低瞬時海平面氣壓在凌晨二時二十分左右為977.2百帕斯卡。
凌晨四時多,莫拉菲移至香港西北方,並逐漸遠離香港,天文台改發八號西南烈風或暴風訊號,清晨時份莫拉菲減弱為強烈熱帶風暴,天文台於六時多再改發三號強風訊號,而隨著莫拉菲深入內陸減弱為熱帶風暴,十時多改發一號戒備訊號,最後當離岸及高地不再吹強風,所有警告於下午取消。莫拉菲在翌日凌晨於廣西減弱為低壓區。
廣泛地區累積雨區達100毫米 共425宗塌樹報告
在七月十九日凌晨時份,莫拉菲的強勁螺旋雨帶橫掃全港,其風眼牆更橫掃新界東北及北部地區,為廣泛地區帶來超過100毫米雨區,天文台先後發出黃色、紅色暴雨警告及山泥傾瀉警告。莫拉菲影響香港期間,全港至少有425宗塌樹報告及3宗棚架倒塌報告。而香港國際機場有11航班取消及31航班需要延誤。
顛峰期間 風力達每小時140公里
莫拉菲的強度在七月十八日午夜時份達顛峰,中心平均風力達每小時140公里,最低中心氣壓約為960百帕斯卡。當時莫拉菲受惠於良好低層輻合及高空輻散,加上垂直風切變微弱,令莫拉菲深層對流持續變得強烈旺盛,從低層微波掃瞄影像清楚可見其良好螺旋組織及低層風眼結構,而根據當時色調強化衛星影像觀察,其中心密集雲層區範圍達200公里左右,雲頂溫度極低。